La structuration de la recherche au niveau de l’école a abouti à deux laboratoires de recherche accrédités. Ces deux laboratoires comportent chacun quatre équipes de recherche.
Le « Laboratoire Énergétique, Matériaux et Environnement » (LEME) travaille dans des domaines en relation avec :
- Acoustique, Energétique et interaction environnementale ;
- Gestion de l’environnement ;
- Synthèse et Corrosion ;
- Restauration du patrimoine.
Le « Laboratoire Analyse des Systèmes, Traitement de l’Information et Management Intégré » (LASTIMI) quant à lui s’intéresse au:
- Management Intégré ;
- Traitement de l’Information et Mathématiques Appliquées ;
- Automatique et diagnostic des défauts ;
- Instrumentation et mesures.
Les deux laboratoires ont été ré-accrédités en 2012. Ils sont adossés au Centre des Etudes Doctorales « Sciences de l’Ingénieur « de l’Ecole Mohammadia d’Ingénieurs.
L’équipe de Management Intégré qui fait partie du LASTIM est adossée depuis 2015 au Centre des Etudes Doctorales » Sciences de gestion » de la Faculté des Sciences Juridiques Economiques et Sociales, Agdal.